כמובן שחוץ מההשפעה החיובית של התרופה, למנוע את היווצרות הדלקת, יש לה גם השפעות שליליות. הרי המערכת החיסונית בגוף שלנו לא נבראה לשווא, יש לה תפקידים קריטיים לתפקודו התקין של הגוף, והפחתה של התפקוד שלה עלולה לגרום לתופעות לוואי, כמו הידבקות בקלות יותר בוירוסים או בזיהומים, וכן עלולה להופיע פגיעה בכבד או בכליות.
משום כך, השימוש בתרופות אלו דורש מעקב רציף של בדיקות דם תקופתיות.